最近做差异基因分析,需要将差异基因表达量映射到 KEGG 通路上生成 pathway 图。我用 Bioconductor 的 pathview 包出图后发现节点大得离谱、颜色也不对。在 AI 帮助下解决了问题,还学到一种新的打补丁方式。
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最近做差异基因分析,需要将差异基因表达量映射到 KEGG 通路上生成 pathway 图。我用 Bioconductor 的 pathview 包出图后发现节点大得离谱、颜色也不对。在 AI 帮助下解决了问题,还学到一种新的打补丁方式。
最近用写了个画图的脚本, 需要一次性用ggplot绘制大量的图片. 虽然在脚本内所有需要使用循环的地方都已经使用上apply了, 但依然架不住一次画几百图, 所以捣鼓了一下parallel, 将画图的部分并行执行以加快速度.