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关于我

关于我页面重整啦! 现在用了Tab将内容折叠起来… 免得太常浪费版面~

个人简介

  • 自称: Silen Wang / Sylens Wong / 汪兴伦, 是一颗逐渐开心起来的卤蛋 (guāng tóu) !
  • 兴趣: 打游戏, 打游戏, 还是TMD 打! 游! 戏! 动漫也看, 但是最近感兴趣番的越来越少了…, 2024年重新开始追番!迷宫饭真是太好看了!都给我去看!
  • 学习/工作路线: 公卫 -> 分子流病 -> 生信 -> 新生抗原 -> 类器官 -> 各种各样
    • emmmm… 越来越博学 (zá luàn) 了
    • 词云更新啦!但是并没有我想象的变化那么大…

摘要词云

  • GitHub:

教育经历

2009.09-2014.06

  • 学校: 广东药学院(现广东药科大学)
  • 学院: 公共卫生学院
  • 专业: 预防医学(本科)
  • 学位: 学士

2014.09-2017.06

  • 学校: 南方医科大学
  • 学院: 公共卫生学院
  • 专业: 流行病与卫生统计学
  • 学位: 硕士

工作履历

  • 2026.05-至今 浙江某医药技术有限公司 AI生物信息研究员
    1. 专利数据采集与治理: 负责专利信息的获取、清洗与结构化, 构建面向模型训练的标准化数据集
    2. 文献调研与模型训练: 结合领域文献调研, 为模型设计、训练与评估提供方案及技术依据
    3. AI技术调研与落地: 跟踪人工智能前沿技术进展, 评估技术路线可行性, 推动其在业务场景中的落地应用
    4. 大模型能力评估: 搭建大语言模型(LLM)能力评测方案, 输出评估结论以支撑模型选型
  • 2024.05-2026.04 杭州某医学科技公司 高级生物信息分析工程师
    1. 开发WES/RNA-Seq/单细胞分析流程
    2. 根据客户要求解读、制订并执行生物信息分析方案
    3. 生物信息数据库构建、运维
    4. 生物信息服务器运维
    5. 网站、系统云服务器运维
    6. 网站、内部实验管理系统开发、运维、迁移、自动化测试
    7. 微信小程序运维
  • 2019.07-2020.03 杭州某生物科技公司 生物信息工程师
    1. 基于NGS的cfDNA分析方案调研, 分析流程搭建
    2. 新生抗原相关数据统计分析
    3. 生物信息分析程序维护
    4. 用药指导报告数据库维护
  • 2020.03-2024.04 杭州某生物科技公司 生信主管
    1. 基于NGS的HLA分型/定量模块开发
    2. 基于flask的生信分析工具后端开发
    3. 新生抗原筛选模块开发
    4. 生信分析主流程维护与升级
    5. 按要求进行材料撰写与修订
  • 就职情况: 杭州某基因科技公司 生信技术部 生物信息工程师
  • 工作内容:
    • 数据处理
      1. cfDNA/FFPE/白细胞样品测序数据处理
      2. 二代测序分析流程构建 / 测试
      3. 二代测序分析用工具开发(Python / R / Julia / Shell)细胞样品测序数据拆分及质量控制
      4. 原始测序数据(fastq)比对, 及质量控制
      5. UMI数据 / Molecular Barcode数据处理
    • 分析流程相关
      1. 对现有生物信息分析流程Debug
      2. 编写新的分析模块并整合进流程框架
      3. 分析模块的测试及Debug
      4. 分析用软件部署及依赖处理
      5. 分析用软件性能测试及分析结果比较
      6. 流程文档的编写与维护
      7. 单细胞测序分析流程的搭建及测试
    • 算法及工具开发:
      1. UMI去重算法比较及复现
      2. 质控图形绘制工具开发
      3. 基于机器学习的变异结果筛选工具的开发
      4. 已有分析工具的效能优化(并行化)
  • 就职情况: 天津某生信服务公司 生物信息分析工程师
  • 工作内容:
    1. 人基因组二代测序数据(WES / WGS)质控及分析
      • 基于频率、基因区域、有害性软件预测、家系遗传模式进行变异结果筛选
      • 依据全基因组关联分析(GWAS)结果定位可能有害的变异
      • 根据客户要求进行筛选方案定制并展示结果
    2. 特定疾病研究现状调研
      • 对特定疾病的基本知识及研究现状进行调研学习,为开发相关分析模块作前置准备
    3. 数据交付流程维护与升级

工作相关技能

常用语言与工具

AI / LLM

编程语言

数据科学/数据库

Web

IDE / Dev

DevOps

可视化

操作系统

编程能力

  • 本地模型部署与推理: Qwen3.x 稠密 / MoE 模型, MLX / omlx / splash 等推理框架; 在 Apple Silicon 与小显存显卡上的上下文(128K)与 KV Cache / TTFT 调优
  • 微调: 基于 Unsloth 的 LoRA / QLoRA、MLX 微调, 面向报告与文档的领域微调
  • 评测: 大模型 / Agent 能力评测(DeepEval 及自建 Benchmark 框架), 支撑模型选型
  • 应用与接入: 大模型 API(DeepSeek 官方及 OpenAI / Anthropic 兼容协议)、RAG 与文献索引、MCP(Model Context Protocol)服务端/客户端、浏览器自动化 Agent
  • Agent 工具: Multica、opencode、Codex CLI、Reasonix 等编码代理, 多 Agent 工作流
  • AIGC: ComfyUI 图像 / 视频生成工作流
  • 并行化: Multiprocess
  • 二代测序常用文件处理: Pysam, PyVCF, CyVCF, Biopython, Scanpy
  • 爬虫:
    • scrapy: 有数个小型爬虫项目经验, 能使用scrapy完成静态页面, 未加密动态页面的爬取和数据
    • 能使用splash, selenium配合scrapy完成动态页面数据的爬取
  • 数据处理/统计计算: Pandas, numpy, math, scipy, statsmodels
  • 自动化测试: Pytest
  • 绘图: Plotly
  • 数据交互展示: Dash
  • 图像处理: pillow
  • WebUI/API搭建: FastAPI, Taipy, flask, gradio, nicegui
  • 办公自动化: docxtpl, openpyxl, python-docx
  • 数据处理: base, dplyr
  • 并行化: Parallel
  • 绘图: ggplot2, ggpubr, ggthemes
  • Web开发: Shiny, plumber
  • Linux系统安装/配置管理: Redhat系发行版操作/维护, Debian系发行版安装/配置/维护, Arch系发行版安装/配置/维护
  • HPC集群管理系统: 有SUN Grid Eengine使用, 维护经验
  • Snakemake: 能熟练编写Snakefile, 熟练Snakemake进行流程构建和管理, 有丰富的Snakemake的实际运用经验
  • Nextflow: 能理解nextflow配置文件的内容,有过将nextflow流程专为Snakemake流程的经验
  • 容器技术:
    • 有容器化开发经验,能够配置符合Devcontainer规范的开发容器,进行本地或远程开发
    • 有丰富的容器使用和部署经验,能使用主流的容器软件如Docker、Podman、Apptainer(原Singularity)能编写Dockerfile和Def文件构建Docker容器或Sif容器(示例)
  • Pixi/Conda/Mamba: 有较充足的实际使用经验, 能够使用conda快速部署分析用软件及流程
  • Git: 有使用Git进行项目代码/文档管理的经验, 懂得基本的创建/推送/合并的方法, 使用过钩子特性运行一些自动化任务操作
  • DevOps: 了解DevOps的基本概念,能使用Github actions / Azure Pipeline平台完成代码管理、以及自动化测试和部署工作; 有Caddy反向代理与Supervisor进程管理的实践经验

生物信息组学经验

  • 比对与 BAM 处理: bwa, samtools, bcftools, bedtools, Picard
  • SNV / INDEL 检测: GATK (Mutect2), Strelka, VarDict
  • 结构变异 / CNV: Manta, Delly, lumpy-sv, CNVkit
  • 变异注释: ANNOVAR, VEP, snpEff
  • 比对 / 定量: STAR, HISAT2, Salmon, kallisto, featureCounts
  • 差异表达与富集: DESeq2, edgeR, GSEA
  • 分析框架: Cell Ranger, Scanpy, Seurat
  • 细胞注释与拟时序: SingleR, celltypist, Monocle, scVelo
  • 细胞通讯: CellChat
  • UMI / 分子标签: UMI-tools, fgbio
  • HLA 分型 / 定量与新生抗原筛选(自研模块)
  • 质控: fastp, FastQC, MultiQC
  • 流程: Snakemake, Nextflow
  • 其他: 质谱鉴定(MaxQuant)

其他工作技能

  • 专利交底撰写
  • 软著撰写
  • 研究论文撰写
  • 静态博客/文档撰写
    • hexo
    • mkdocs
    • gitbook

可展示项目

个人开源项目

已发表文献

参与的文章一般仅负责生信相关部分

  1. Ye Feng et al., “Multi-Epitope Vaccine Design Using an Immunoinformatic Approach for SARS-CoV-2” Pathogens 10 (June 11, 2021) 737.
  2. Zheling Chen et al., “A Neoantigen-Based Peptide Vaccine for Patients With Advanced Pancreatic Cancer Refractory to Standard Treatment” Front. Immunol. 12 (2021) 691605.
  3. Jiawei Shou et al., “Combination Treatment of Radiofrequency Ablation and Peptide Neoantigen Vaccination: Promising Modality for Future Cancer Immunotherapy” Front. Immunol. 13 (September 29, 2022) 1000681.

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