关于我
关于我页面重整啦! 现在用了Tab将内容折叠起来… 免得太常浪费版面~
个人简介
- 自称: Silen Wang / Sylens Wong / 汪兴伦, 是一颗逐渐开心起来的卤蛋!
- 兴趣: 打游戏, 打游戏, 还是TMD 打! 游! 戏! 动漫也看,
但是最近感兴趣番的越来越少了…, 2024年重新开始追番!迷宫饭真是太好看了!都给我去看! - 学习/工作路线: 公卫 -> 分子流病 -> 生信 -> 新生抗原 -> 类器官 -> 各种各样
- emmmm… 越来越博学了
- 词云更新啦!但是并没有我想象的变化那么大…

- GitHub:
教育经历
- 学校: 广东药学院(现广东药科大学)
- 学院: 公共卫生学院
- 专业: 预防医学(本科)
- 学位: 学士
- 学校: 南方医科大学
- 学院: 公共卫生学院
- 专业: 流行病与卫生统计学
- 学位: 硕士
工作履历
- 2026.05-至今 浙江某医药技术有限公司 AI生物信息研究员
- 专利数据采集与治理: 负责专利信息的获取、清洗与结构化, 构建面向模型训练的标准化数据集
- 文献调研与模型训练: 结合领域文献调研, 为模型设计、训练与评估提供方案及技术依据
- AI技术调研与落地: 跟踪人工智能前沿技术进展, 评估技术路线可行性, 推动其在业务场景中的落地应用
- 大模型能力评估: 搭建大语言模型(LLM)能力评测方案, 输出评估结论以支撑模型选型
- 2024.05-2026.04 杭州某医学科技公司 高级生物信息分析工程师
- 开发WES/RNA-Seq/单细胞分析流程
- 根据客户要求解读、制订并执行生物信息分析方案
- 生物信息数据库构建、运维
- 生物信息服务器运维
- 网站、系统云服务器运维
- 网站、内部实验管理系统开发、运维、迁移、自动化测试
- 微信小程序运维
- 2019.07-2020.03 杭州某生物科技公司 生物信息工程师
- 基于NGS的cfDNA分析方案调研, 分析流程搭建
- 新生抗原相关数据统计分析
- 生物信息分析程序维护
- 用药指导报告数据库维护
- 2020.03-2024.04 杭州某生物科技公司 生信主管
- 基于NGS的HLA分型/定量模块开发
- 基于flask的生信分析工具后端开发
- 新生抗原筛选模块开发
- 生信分析主流程维护与升级
- 按要求进行材料撰写与修订
- 就职情况: 杭州某基因科技公司 生信技术部 生物信息工程师
- 工作内容:
- 数据处理
- cfDNA/FFPE/白细胞样品测序数据处理
- 二代测序分析流程构建 / 测试
- 二代测序分析用工具开发(Python / R / Julia / Shell)细胞样品测序数据拆分及质量控制
- 原始测序数据(fastq)比对, 及质量控制
- UMI数据 / Molecular Barcode数据处理
- 分析流程相关
- 对现有生物信息分析流程Debug
- 编写新的分析模块并整合进流程框架
- 分析模块的测试及Debug
- 分析用软件部署及依赖处理
- 分析用软件性能测试及分析结果比较
- 流程文档的编写与维护
- 单细胞测序分析流程的搭建及测试
- 算法及工具开发:
- UMI去重算法比较及复现
- 质控图形绘制工具开发
- 基于机器学习的变异结果筛选工具的开发
- 已有分析工具的效能优化(并行化)
- 数据处理
- 就职情况: 天津某生信服务公司 生物信息分析工程师
- 工作内容:
- 人基因组二代测序数据(WES / WGS)质控及分析
- 基于频率、基因区域、有害性软件预测、家系遗传模式进行变异结果筛选
- 依据全基因组关联分析(GWAS)结果定位可能有害的变异
- 根据客户要求进行筛选方案定制并展示结果
- 特定疾病研究现状调研
- 对特定疾病的基本知识及研究现状进行调研学习,为开发相关分析模块作前置准备
- 数据交付流程维护与升级
- 人基因组二代测序数据(WES / WGS)质控及分析
工作相关技能
常用语言与工具
AI / LLM
编程语言
数据科学/数据库
Web
IDE / Dev
DevOps
可视化
操作系统
编程能力
- 本地模型部署与推理: Qwen3.x 稠密 / MoE 模型, MLX / omlx / splash 等推理框架; 在 Apple Silicon 与小显存显卡上的上下文(128K)与 KV Cache / TTFT 调优
- 微调: 基于 Unsloth 的 LoRA / QLoRA、MLX 微调, 面向报告与文档的领域微调
- 评测: 大模型 / Agent 能力评测(DeepEval 及自建 Benchmark 框架), 支撑模型选型
- 应用与接入: 大模型 API(DeepSeek 官方及 OpenAI / Anthropic 兼容协议)、RAG 与文献索引、MCP(Model Context Protocol)服务端/客户端、浏览器自动化 Agent
- Agent 工具: Multica、opencode、Codex CLI、Reasonix 等编码代理, 多 Agent 工作流
- AIGC: ComfyUI 图像 / 视频生成工作流
- 并行化: Multiprocess
- 二代测序常用文件处理: Pysam, PyVCF, CyVCF, Biopython, Scanpy
- 爬虫:
- scrapy: 有数个小型爬虫项目经验, 能使用scrapy完成静态页面, 未加密动态页面的爬取和数据
- 能使用splash, selenium配合scrapy完成动态页面数据的爬取
- 数据处理/统计计算: Pandas, numpy, math, scipy, statsmodels
- 自动化测试: Pytest
- 绘图: Plotly
- 数据交互展示: Dash
- 图像处理: pillow
- WebUI/API搭建: FastAPI, Taipy, flask, gradio, nicegui
- 办公自动化: docxtpl, openpyxl, python-docx
- 数据处理: base, dplyr
- 并行化: Parallel
- 绘图: ggplot2, ggpubr, ggthemes
- Web开发: Shiny, plumber
- Linux系统安装/配置管理: Redhat系发行版操作/维护, Debian系发行版安装/配置/维护, Arch系发行版安装/配置/维护
- HPC集群管理系统: 有SUN Grid Eengine使用, 维护经验
- Snakemake: 能熟练编写Snakefile, 熟练Snakemake进行流程构建和管理, 有丰富的Snakemake的实际运用经验
- Nextflow: 能理解nextflow配置文件的内容,有过将nextflow流程专为Snakemake流程的经验
- 容器技术:
- 有容器化开发经验,能够配置符合Devcontainer规范的开发容器,进行本地或远程开发
- 有丰富的容器使用和部署经验,能使用主流的容器软件如Docker、Podman、Apptainer(原Singularity)能编写Dockerfile和Def文件构建Docker容器或Sif容器(示例)
- Pixi/Conda/Mamba: 有较充足的实际使用经验, 能够使用conda快速部署分析用软件及流程
- Git: 有使用Git进行项目代码/文档管理的经验, 懂得基本的创建/推送/合并的方法, 使用过钩子特性运行一些自动化任务操作
- DevOps: 了解DevOps的基本概念,能使用Github actions / Azure Pipeline平台完成代码管理、以及自动化测试和部署工作; 有Caddy反向代理与Supervisor进程管理的实践经验
生物信息组学经验
- 比对与 BAM 处理: bwa, samtools, bcftools, bedtools, Picard
- SNV / INDEL 检测: GATK (Mutect2), Strelka, VarDict
- 结构变异 / CNV: Manta, Delly, lumpy-sv, CNVkit
- 变异注释: ANNOVAR, VEP, snpEff
- 比对 / 定量: STAR, HISAT2, Salmon, kallisto, featureCounts
- 差异表达与富集: DESeq2, edgeR, GSEA
- 分析框架: Cell Ranger, Scanpy, Seurat
- 细胞注释与拟时序: SingleR, celltypist, Monocle, scVelo
- 细胞通讯: CellChat
- UMI / 分子标签: UMI-tools, fgbio
- HLA 分型 / 定量与新生抗原筛选(自研模块)
- 质控: fastp, FastQC, MultiQC
- 流程: Snakemake, Nextflow
- 其他: 质谱鉴定(MaxQuant)
其他工作技能
- 专利交底撰写
- 软著撰写
- 研究论文撰写
- 静态博客/文档撰写
- hexo
- mkdocs
- gitbook
可展示项目
个人开源项目
已发表文献
参与的文章一般仅负责生信相关部分
- Ye Feng et al., “Multi-Epitope Vaccine Design Using an Immunoinformatic Approach for SARS-CoV-2” Pathogens 10 (June 11, 2021) 737.
- Zheling Chen et al., “A Neoantigen-Based Peptide Vaccine for Patients With Advanced Pancreatic Cancer Refractory to Standard Treatment” Front. Immunol. 12 (2021) 691605.
- Jiawei Shou et al., “Combination Treatment of Radiofrequency Ablation and Peptide Neoantigen Vaccination: Promising Modality for Future Cancer Immunotherapy” Front. Immunol. 13 (September 29, 2022) 1000681.