在我们现在基于scanp的单细胞流程中,有一步需要将AnnData对象保存为loom格式。但是与保存为h5ad不同,当我们不做任何处理,将AnnData对象写入loom文件后再次读取时,会发现obs和var的索引(index)信息丢失了,这些索引(通常是细胞条形码和基因名)变成了普通的数字编号。
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在我们现在基于scanp的单细胞流程中,有一步需要将AnnData对象保存为loom格式。但是与保存为h5ad不同,当我们不做任何处理,将AnnData对象写入loom文件后再次读取时,会发现obs和var的索引(index)信息丢失了,这些索引(通常是细胞条形码和基因名)变成了普通的数字编号。