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从事生物信息分析,研究方向越前沿,就要面临越多来自信息侧的问题。即使是文章发的非常好,原作者共享了代码,甚至写了现成软件工具,也不代表我们能轻松顺利的用这些现成的东西来复现或进行研究,混乱的环境设置只是一方面,更多时候,由于软件作者并不是专业的软件工程师,工具功能大致能用已经谢天谢地了,不能奢望这些软件没有一点毛病,更不能奢望有性能可言(除非开发时性能被来就是开发点)。即使这工具来自于有实力的大实验室,很多时候也不能幸免,比如… Azimuth。

人无语的时候,真的会笑出来,我的直接领导又又又又又又离职了,为什么这么多又,来来来,我们画个时间线盘一盘,我到底克过多少顶头上司。

生物信息是一门交叉学科,而生物信息学中使用的工具集或技术栈,也是相当的“交叉”,其碎片化的程度,我绝对不亚于Linux发行版… 这也带来了大家都会面临的难题:生物信息分析环境部署。

写流程是生物信息分析中经常需要涉及的工作, 一个成熟完善的好工具可以使工作的效率大大提高.