在使用pixi管理生物信息学分析环境时,经常会遇到一些Bioconductor的R包安装后出现依赖缺失的问题。目前暂不清楚这个问题的原因,用了pixi一年了,这个问题到目前为止(2025.10)也木有修复,因此本文介绍如何通过pixi tasks功能来解决这类问题。
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在使用pixi管理生物信息学分析环境时,经常会遇到一些Bioconductor的R包安装后出现依赖缺失的问题。目前暂不清楚这个问题的原因,用了pixi一年了,这个问题到目前为止(2025.10)也木有修复,因此本文介绍如何通过pixi tasks功能来解决这类问题。
生物信息是一门交叉学科,而生物信息学中使用的工具集或技术栈,也是相当的“交叉”,其碎片化的程度,我绝对不亚于Linux发行版… 这也带来了大家都会面临的难题:生物信息分析环境部署。