R中可以方便的使用多进程, Python中也有类似的东西.

最近用写了个画图的脚本, 需要一次性用ggplot绘制大量的图片. 虽然在脚本内所有需要使用循环的地方都已经使用上apply了, 但依然架不住一次画几百图, 所以捣鼓了一下parellel, 将画图的部分并行执行已加快速度.

好久不更了, 今天来记录一下自制vpn的升级版~

Snakemake 确实是非常好用的流程开发及管理工具. 但是在特定的场景下…它也会带来一些问题, 然后在机缘巧合下, 我发现了一种非常蛋疼的使用方式: 只使用snakemake的依赖处理和人物管理, 执行脚本另外生成.

写流程是生物信息分析中经常需要涉及的工作, 一个成熟完善的好工具可以使工作的效率大大提高.

bash-it是受oh-my-zsh启发而创建的bash插件集合项目. 安装上bash-it不仅可以让bash界面变得更炫酷, 也可以让命令行变得更为好用

一直都在用argparse写命令行解析, 但是直到前段时间才发现原来它可以用来写子命令

原来又撞到了bug….

装软件的时候想了想, 用conda的移植性和可行性还是更好一些, 所以想用conda再尝试一下, 顺便可以看看snakemake怎么样…