之前自建了一个gogs, 但是并没有弄https, 直接用的http, 上次自己试了一下发现截密码太容易了…所以思考了一下…还是弄个域名然后上了https…
进行软件开发时, 不论是为了展示或者是自己梳理需要都会要用到流程图, 如果自己开个绘图板或者word来画呢也不是不可以, 但是如果图一单复杂了, 或者图是不是会需要更改的话, 就很花时间了, 因此一个类似markdown这样可以让人专注与内容而不是形式的工具就非常重要了.
之前已经在R和Python中都使用过并行了, 我是最近才知道原来Bash下面也有简单好用的并行程序: GNU Parallel[^1]. 这是一个Perl实现的程序, 可以方便的将Bash中各种命令并行执行.
Lumpy作者对这个项目的定位与其说是做一个好用的工具, 不如说是构建一个通用的结构变异信号生成方案, 然后顺便对这个方案做了一个基本的实现. 与其他工具相比, lumpy的文章中花了更多的篇幅去阐述这个方案中设定的证据概念, 及获取信息的方案. 解读这个工具让我更加了解如何从NGS测序数据中获取结构变异的信号.