“我所知道的结构变异相关信息”这个博客构想的内容有点太多了, 一次写太多我自己回查也不是很方便, 所以还是决定拆成各个小的部分, 之后再用gitbook写个综合的.

想不到4年之后, 又要弄回归了…这一次用的R而不是SPSS, 之前作的是统计分析, 这次…居然变成机器学习了…

昨天因为markdown文章里面用了无法解析的符号, 导致我以为hexo挂了, 遂折腾换了新的主题…顺便又回顾了一下搭建过程

在使用snakemake一段时间后, 发现其中确实有很多实用的特性来方便平常的分析, 做个记录整理

原来写脚本的时候很多实用的功能都没有用过, 这次学习了一点点, 做个记录

R中可以方便的使用多进程, Python中也有类似的东西.

最近用写了个画图的脚本, 需要一次性用ggplot绘制大量的图片. 虽然在脚本内所有需要使用循环的地方都已经使用上apply了, 但依然架不住一次画几百图, 所以捣鼓了一下parellel, 将画图的部分并行执行已加快速度.

好久不更了, 今天来记录一下自制vpn的升级版~

Snakemake 确实是非常好用的流程开发及管理工具. 但是在特定的场景下…它也会带来一些问题, 然后在机缘巧合下, 我发现了一种非常蛋疼的使用方式: 只使用snakemake的依赖处理和人物管理, 执行脚本另外生成.

写流程是生物信息分析中经常需要涉及的工作, 一个成熟完善的好工具可以使工作的效率大大提高.