Snakemake 确实是非常好用的流程开发及管理工具. 但是在特定的场景下…它也会带来一些问题, 然后在机缘巧合下, 我发现了一种非常蛋疼的使用方式: 只使用snakemake的依赖处理和人物管理, 执行脚本另外生成.

bash-it是受oh-my-zsh启发而创建的bash插件集合项目. 安装上bash-it不仅可以让bash界面变得更炫酷, 也可以让命令行变得更为好用

一直都在用argparse写命令行解析, 但是直到前段时间才发现原来它可以用来写子命令

原来又撞到了bug….

装软件的时候想了想, 用conda的移植性和可行性还是更好一些, 所以想用conda再尝试一下, 顺便可以看看snakemake怎么样…

用R总是会碰到各种问题, 收集一下

R安装github上面的包有时会出现连接不到github的问题, 记录一下解决方案

最近用Pandas比较多, 把常用的东西摘抄一下备查

为了以后操作使用Sqlite3做准备, 上周上班的时候特意试了一下用操作数据库的数据, 为了方便直接用了sqlite3, 没想到sqlite3并不是所有语句都支持, 并且sqlite自由的点命令是无法被python的sqlite模块调用的….

正则在很多时候时候都还是相当实用的的, 然而不同程序中正则的写法总用些差异, 所以做个cheatsheet备查不亏~