很早之前, 前公司的Python大神就有给我们科普过装饰器的使用, 但是由于个人愚钝, 一直没有很好理解这个东西, 也没有在实际的写代码的时候用过. 因此这里把这种工作总遇到的一个例子记录一下.

使用Bash串联各个程序的过程中总是能发现一些神奇好用的技巧, 这里记录两个.

为了学习Go语言, 我把之前工作中一个用的比较多的脚本用Go重写了. 所谓没有对比就没有伤害, 实际写下来的感受是, Python真的简单快捷易懂…好用的第三方模块多…中英文的学习资料更是非常容易找. 要不是为了性能…我真是不想换…

之前已经在R和Python中都使用过并行了, 我是最近才知道原来Bash下面也有简单好用的并行程序: GNU Parallel[^1]. 这是一个Perl实现的程序, 可以方便的将Bash中各种命令并行执行.

在使用snakemake一段时间后, 发现其中确实有很多实用的特性来方便平常的分析, 做个记录整理

原来写脚本的时候很多实用的功能都没有用过, 这次学习了一点点, 做个记录

R中可以方便的使用多进程, Python中也有类似的东西.

最近用写了个画图的脚本, 需要一次性用ggplot绘制大量的图片. 虽然在脚本内所有需要使用循环的地方都已经使用上apply了, 但依然架不住一次画几百图, 所以捣鼓了一下parellel, 将画图的部分并行执行已加快速度.

好久不更了, 今天来记录一下自制vpn的升级版~

Snakemake 确实是非常好用的流程开发及管理工具. 但是在特定的场景下…它也会带来一些问题, 然后在机缘巧合下, 我发现了一种非常蛋疼的使用方式: 只使用snakemake的依赖处理和人物管理, 执行脚本另外生成.