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生物信息是一门交叉学科,而生物信息学中使用的工具集或技术栈,也是相当的“交叉”,其片化的程度,我是觉得绝对不亚于Linux发行版… 这也带来了大家都会面临的难题:生物信息分析环境部署。

去年的时候,我突然看躺在床上的杂牌笔记本电脑特别不爽。好歹也是当年1999买回来的(对毕业半年的我来说是非常大件的消费),后续还因为键盘和触控板问题修了两次花了又快又1000块。这么贵重的东西,不给他安排点活,着时对不起自己的血汗钱。于是我又捣鼓起了几年前关注过,但是当时特别不能用的fydeos。这一捣鼓,我才发现,这几年不仅是deepin发展的很快(快到都有钱和时间把做好的框架和UI又推了重来),fydeos也进化了很多,不仅有了android,还有了linux子系统,日常使用突然就变得不再遥远了,于是!我,斥、重、金————————海鲜市场捡垃圾买了个lenovo chromebook duet..

其实很早之前就知道singularity这个东西了,作为有别于docker,专门为HPC开发的容器,一直都想试试。奈何就像Illumina以外的其他NGS技术一样,singularity虽然没有挂,但是至今都没有什么声量,而且在k8s这种容器集群管理方案被绝大多数云厂商采纳后,singularity要竞争似乎更难了… 当然这跟我现在没什么关系… 咱目前离上云感觉至少还有三五年的距离,因此在本地集群启用这个感觉完全合乎情理。

今天需要部署个Rstudio给别人用, 记录一下部署的步骤以及要点

最近出于…..emmmmmm心有不甘?我卖掉了之前拍的lenovo chrome duet2,但是转头又买了pixelbook 2017…..既然设备到手了,还是想要继续折腾一阵,力求找到用这台pixelbook 2017代替我的工作电脑进行一般办公的方式。然后找着找着,主要矛盾没解决,倒是诞生了几个实用的副产品…. 使用codespace写hexo博客是其一。

这个标题有点点套娃… 但是事实确实如此. 在之前认识到chatGPT确实能比较好的回答代码问题之后, 我突然觉得我行了! 我终于有可能做全栈了! 于是为了展示chatGPT加持下的个人实力, 我准备写个用chatGPT读论文的程序(其实有考虑用这个辅助做meta分析)!

chatGPT火了这么久, 我昨天才正式因为想用它生成一些东西才弄了个号, 就像网上很多人说的, 虽然在专业问题上他确实可能是大忽悠, 但是对于写代码来说, 反正我最后是要自己跑和自己测试的, 实践出真知, 给个大致正确的方向也好呀!