进行测试时经常要新建一个conda环境, 然后将环境装上jupyter内核后用notebook进行测试. 每次注册新内核都要重查, 所以还是做个记录好了…

我目前在工作中已经几乎不用R做数据处理或者数据清洗了, 因为日常工作的数据整理工作涉及大量的字符串提取/处理工作, 这些用R弄起来很难受. 另外R的错误追踪实在是很吃对代码的熟练度和编写经验, 让我这种只是写写简单脚本, 没什么编程规范意识的人编写和维护R代码简直要命(上间公司尝试过了…), 但是最近有同学要求我使用R语言来完成这类工作(因为他只会R), 于是在艰难抄代码的过程中我发现了一条新的不用R做这种工作的理由…

今天碰到一个做图问题, 学到了一个新的小技巧, 记录一下

最近用写了个画图的脚本, 需要一次性用ggplot绘制大量的图片. 虽然在脚本内所有需要使用循环的地方都已经使用上apply了, 但依然架不住一次画几百图, 所以捣鼓了一下parellel, 将画图的部分并行执行已加快速度.

原来又撞到了bug….

装软件的时候想了想, 用conda的移植性和可行性还是更好一些, 所以想用conda再尝试一下, 顺便可以看看snakemake怎么样…

用R总是会碰到各种问题, 收集一下

R安装github上面的包有时会出现连接不到github的问题, 记录一下解决方案

由于工作需要, 得安装一篇文献中提及的一个包, 本两想着两条命令完事, 谁知道一大堆依赖要解决…然后linux下的R包都是要编译的, 这可是要了老命了…还好有conda这个东西…

研究生期间参加广东省疾控R培训的笔记, 这算是我真正意义上的编程入门课了